Maljković je počeo igračku karijeru u KK „Mrakovica“ iz Prijedora, potom kao srednjoškolac igrao prvu ligu Jugoslavije za KK „Sloboda Dita“ iz Tuzle.
U periodu od 1988. do 1996. godine usledio je odlazak u Novi Sad, gde je nastupao za KK „NAP“ i za KK „Vojvodina“.
Nakon uspešnih nastupa na domaćim prostorima, Boris je nastavio igračku karijeru u Mađarskoj za više klubova: Pokš, Debrecin, Solnok, MAFC Budimpešta.
Kako trener i koordinator radio je u Budimpešti sa Sentandrejom, Kečkemetom i sa ženskom ekipama iz Pečuja i Seksarda. Ostavio je dubok trag u ženskoj košarci. Bio je drugi trener Peac-Pečuja u sezoni 2014/15, azatim i glavni trener u sezoni 2016/17. Nakon toga je kao drugi trener radio u ekipi Atomeromu Seksarda.
Poslednje dve godine života, radio je u Njiređhazi (Nyíregyháza) kao trener i koordinator.
Vodio je U16 Mađarsku mušku reprezentaciju.
Iza sebe je ostavio suprugu Minju i ćerku Saru (21).
Počivaj u miru.